作為北京市政府深化醫改工作的創新舉措之一，由中國醫藥衛生事業發展基金會，北京市衛生局，北京市醫院管理局，北京市中醫管理局為發起單位，創建“北京醫生網”，同時成立北京醫生有限責任公司，作為網站運營主體。“北京醫生網”是為適應醫療衛生事業發展新形勢以及滿足民眾就醫需求的新變化，由致力於公益事業和醫療服務的社會 力量出資建設，並由政府各相關部門積極支持配合組建的一個資源共享平台，對解決民眾尋醫問藥難題，緩解醫療資源緊張，引導患者有序就醫，構建新型就醫服務 模式進行新的探索。為了更有效地協調醫療信息資源，指導網站規範運營，市政府指定北京市中醫管理局牽頭，成立了由北京市發展和改革委 員會，北京市經濟和信息化委員會，北京市財政局，北京市審計局，北京市工商局，北京市質量技術監督局，北京市衛生局，北京市醫院管理局，北京市中醫管理局 以及中國醫藥衛生事業發展基金會，北京市中醫學會等組成的“北京醫生網”理事會。